کارگاه تصویر‌برداری مغزی (ساختاری و عملکردی)

سرفصل‌ها و جلسات دوره:
جلسه ۱- مقدمه‌ای بر FMRI 1 - 1- مقدمه 2 - 2- اثر پارامترهای سیگنال بر تصویر 3 - 3- سیگنال MRI 4 - 4- تصویربرداری Pulse Sequence 5 - 5- Echo Planar Imaging (EPI) 6 - 6- MIR Contrast (1) 7 - 7- (MIR Contrast (2 8 - 8- (MIR Contrast (3 9 - 9- (MIR Contrast (4 10 - 10- (MIR Contrast (5 11 - 11- تحلیل ساختار مغز
جلسه ۲- اصول اولیه MRI 1 - 12- مقدمه 2 - 13- تاریخچه MRI 3 - 14- RF Pulse 4 - 15- T1 5 - 16- T2 6 - 17- بردار مغناطیسی طولی-عرضی- 1 7 - 18- بردار مغناطیسی طولی-عرضی- 2 8 - 19- T1 Weighted Image 9 - 20- T2 Weighted Image 10 - 21- Gradient coils 11 - 22- Single-shot EPI
جلسه ۳- آناتومی تصویربرداری عصبی 1 - 23- مقدمه 2 - 24-تکنیک های نقشه برداری مغز 3 - 25- مراحل مطالعه FMRI- ساختاری 4 - 26- برش‌های مغز 5 - 27- مراحل مطالعه FMRI- عملکردی 6 - 28- 4D Data 7 - 29- مطالعه نواحی فعالیت 8 - 30- Task Design Study 9 - 31- کاربردهای FMRI-1 10 - 32- کاربردهای FMRI-2 11 - 33- کاربردهای FMRI-3 12 - 34- کاربردهای FMRI-4 13 - 35- کاربردهای FMRI-5 14 - 36- کاربردهای FMRI-6 15 - 37- سیگنال FMRI 16 - 38- BOLD Signal-1 17 - 39- BOLD Signal-2 18 - 40- HRF 19 - 41- The Bold Time Course 20 - 42- Comparing Predictable HRF 21 - 43- مروری بر مراحل FMRI 22 - 44- Subtraction 23 - 45- آناتومی مغز- 1 24 - 46- آناتومی مغز- 2 25 - 47- Talairach Coordinate System 26 - 48- Talairach Atlas Space 27 - 49- Normalization 28 - 50- Introduction to The NITRC Site
جلسه ۴- معرفی نرم افزار FSL 1 - 51- مقدمه 2 - 52- FSL 3 - 53- ویژگی‌های FSL 4 - 54- چگونگی کار با FSL-1 5 - 55- چگونگی کار با FSL-2 6 - 56- چگونگی کار با FSL-3
جلسه ۵- آماده سازی داده جهت آنالیز 1 - 57- FSL یا SPM 2 - 58- اجرای FSL 3 - 59- 3D & 4D Files 4 - 60- FMRI Time Series 5 - 61- مروری بر FSL 6 - 62- حذف Volume های اولیه- اصلاح حرکت 7 - 63- مقابله با حرکت 8 - 64- تاثیر اصلاح حرکت- اصلاح زمان بندی Slice ها 9 - 65- فیلترینگ مکانی 10 - 66- فیلترینگ زمانی 11 - 67- Global Intensity Normalization 12 - 68- Cost Function
جلسه ۶- ادامه مفاهیم تصویربرداری مغزی 1 - 69- یکپارچگی- تفکیک 2 - 70- Resting- State Normalization 3 - 71- انواع اتصال 4 - 72- Exploratory Vs. Confinatory 5 - 73- اهداف 6 - 74- مدل ICA 7 - 75- ;کاربرد ICA 8 - 76- مدل های ICA گروهی 9 - 77- سری‌های زمانی 10 - 78- عملی-1 11 - 79- عملی-2 12 - 80- عملی-3 13 - 81- عملی-4
جلسه ۷- Single-Session Analysis 1 - 82- مدل کردن FMRI 2 - 83- ساخت یک مدل 3 - 84- GLM 4 - 85- t-Contrast-1 5 - 86- سوال 6 - 87- t-Contrast-2 7 - 88- ?Inferring Activity B Non-zero 8 - 89- مصاحبه
جلسه ۸- جلسه عملی با FEAT 1 - 90- Single Subject FMRI 2 - 91- عملی- 1 3 - 92- عملی- 2 4 - 93- عملی- 3
جلسه ۹- آنالیز گروهی FMRI 1 - 94- آنالیز چند سطحی FMRI 2 - 95- انتخاب روش 3 - 96- تفاوت دو گروه ناهمگن 4 - 97- Paired-Test
جلسه ۱۰- تصویربرداری ساختاری 1 - 98- مقدمه 2 - 99- Structural MRI 3 - 100- جداسازی اجزای داخل ماده خاکستری مغز 4 - 101- شکل سنجی 5 - 102- مقایسه ضخامت قشر مخ 6 - 103- VBM 7 - 104- سوال 8 - 105- Data Sharing
جلسه ۱۱- FMRI Signal Interest 1 - 106- مقدمه 2 - 107- Hypothesis 3 - 108- تست 4 - 109- طراحی تجربه 5 - 110- روش‌های تفاضل 6 - 111- سطوح زبان 7 - 112- سطوح سلسله مراتبی یک کار 8 - 113- فرض اصلی 9 - 114- کنترل با عدم کنترل
جلسه ۱۲- ادامه مفاهیم تصویربرداری مغزی 1 - 115- طراحی اشتراک 2 - 116- سوال 3 - 117- تعامل عملکردهای شناختی 4 - 118- طراحی پارامتریک 5 - 119- طراحی انطباق 6 - 120- مثال 7 - 121- تاثیر صدای بلنددر مقایسه با صدای کوتاه بر نواحی مغزی 8 - 122- Multi Blocked Design 9 - 123- طراحی مرتبط با یک رویداد 10 - 124- Block Vs. Event Related Designs 11 - 125- Periodic Signal Trial Design 12 - 126- طراحی مختلط 13 - 127- جمع بندی
جلسه ۱۳- تصویربرداری ساختاری (عملی) 1 - 128- مقدمه 2 - 129- FAST-1 3 - 130- - FAST-2 4 - 131- First 5 - 132- اجرای First 6 - 133- VBM-1 7 - 134- VBM-2 8 - 135- Voxel Based Analysis of GM Volume 9 - 136- تفاسیری از تفاوت‌ها 10 - 137- اجرای FSL-VBM 11 - 138- Free Surface 12 - 139- عملی-1 13 - 140- عملی-2 14 - 141- عملی-3 15 - 142- عملی_4 16 - 143- عملی-5 17 - 144- عملی-6 18 - 145- عملی-7

سرفصل‌ها و جلسات دوره:

جلسه ۱- مقدمه‌ای بر FMRI

1 - 1- مقدمه

2 - 2- اثر پارامترهای سیگنال بر تصویر

3 - 3- سیگنال MRI

4 - 4- تصویربرداری Pulse Sequence

5 - 5- Echo Planar Imaging (EPI)

6 - 6- MIR Contrast (1)

7 - 7- (MIR Contrast (2

8 - 8- (MIR Contrast (3

9 - 9- (MIR Contrast (4

10 - 10- (MIR Contrast (5

11 - 11- تحلیل ساختار مغز

جلسه ۲- اصول اولیه MRI

1 - 12- مقدمه

2 - 13- تاریخچه MRI

3 - 14- RF Pulse

4 - 15- T1

5 - 16- T2

6 - 17- بردار مغناطیسی طولی-عرضی- 1

7 - 18- بردار مغناطیسی طولی-عرضی- 2

8 - 19- T1 Weighted Image

9 - 20- T2 Weighted Image

10 - 21- Gradient coils

11 - 22- Single-shot EPI

جلسه ۳- آناتومی تصویربرداری عصبی

1 - 23- مقدمه

2 - 24-تکنیک های نقشه برداری مغز

3 - 25- مراحل مطالعه FMRI- ساختاری

4 - 26- برش‌های مغز

5 - 27- مراحل مطالعه FMRI- عملکردی

6 - 28- 4D Data

7 - 29- مطالعه نواحی فعالیت

8 - 30- Task Design Study

9 - 31- کاربردهای FMRI-1

10 - 32- کاربردهای FMRI-2

11 - 33- کاربردهای FMRI-3

12 - 34- کاربردهای FMRI-4

13 - 35- کاربردهای FMRI-5

14 - 36- کاربردهای FMRI-6

15 - 37- سیگنال FMRI

16 - 38- BOLD Signal-1

17 - 39- BOLD Signal-2

18 - 40- HRF

19 - 41- The Bold Time Course

20 - 42- Comparing Predictable HRF

21 - 43- مروری بر مراحل FMRI

22 - 44- Subtraction

23 - 45- آناتومی مغز- 1

24 - 46- آناتومی مغز- 2

25 - 47- Talairach Coordinate System

26 - 48- Talairach Atlas Space

27 - 49- Normalization

28 - 50- Introduction to The NITRC Site

جلسه ۴- معرفی نرم افزار FSL

1 - 51- مقدمه

2 - 52- FSL

3 - 53- ویژگی‌های FSL

4 - 54- چگونگی کار با FSL-1

5 - 55- چگونگی کار با FSL-2

6 - 56- چگونگی کار با FSL-3

جلسه ۵- آماده سازی داده جهت آنالیز

1 - 57- FSL یا SPM

2 - 58- اجرای FSL

3 - 59- 3D & 4D Files

4 - 60- FMRI Time Series

5 - 61- مروری بر FSL

6 - 62- حذف Volume های اولیه- اصلاح حرکت

7 - 63- مقابله با حرکت

8 - 64- تاثیر اصلاح حرکت- اصلاح زمان بندی Slice ها

9 - 65- فیلترینگ مکانی

10 - 66- فیلترینگ زمانی

11 - 67- Global Intensity Normalization

12 - 68- Cost Function

جلسه ۶- ادامه مفاهیم تصویربرداری مغزی

1 - 69- یکپارچگی- تفکیک

2 - 70- Resting- State Normalization

3 - 71- انواع اتصال

4 - 72- Exploratory Vs. Confinatory

5 - 73- اهداف

6 - 74- مدل ICA

7 - 75- ;کاربرد ICA

8 - 76- مدل های ICA گروهی

9 - 77- سری‌های زمانی

10 - 78- عملی-1

11 - 79- عملی-2

12 - 80- عملی-3

13 - 81- عملی-4

جلسه ۷- Single-Session Analysis

1 - 82- مدل کردن FMRI

2 - 83- ساخت یک مدل

3 - 84- GLM

4 - 85- t-Contrast-1

5 - 86- سوال

6 - 87- t-Contrast-2

7 - 88- ?Inferring Activity B Non-zero

8 - 89- مصاحبه

جلسه ۸- جلسه عملی با FEAT

1 - 90- Single Subject FMRI

2 - 91- عملی- 1

3 - 92- عملی- 2

4 - 93- عملی- 3

جلسه ۹- آنالیز گروهی FMRI

1 - 94- آنالیز چند سطحی FMRI

2 - 95- انتخاب روش

3 - 96- تفاوت دو گروه ناهمگن

4 - 97- Paired-Test

جلسه ۱۰- تصویربرداری ساختاری

1 - 98- مقدمه

2 - 99- Structural MRI

3 - 100- جداسازی اجزای داخل ماده خاکستری مغز

4 - 101- شکل سنجی

5 - 102- مقایسه ضخامت قشر مخ

6 - 103- VBM

7 - 104- سوال

8 - 105- Data Sharing

جلسه ۱۱- FMRI Signal Interest

1 - 106- مقدمه

2 - 107- Hypothesis

3 - 108- تست

4 - 109- طراحی تجربه

5 - 110- روش‌های تفاضل

6 - 111- سطوح زبان

7 - 112- سطوح سلسله مراتبی یک کار

8 - 113- فرض اصلی

9 - 114- کنترل با عدم کنترل

جلسه ۱۲- ادامه مفاهیم تصویربرداری مغزی

1 - 115- طراحی اشتراک

2 - 116- سوال

3 - 117- تعامل عملکردهای شناختی

4 - 118- طراحی پارامتریک

5 - 119- طراحی انطباق

6 - 120- مثال

7 - 121- تاثیر صدای بلنددر مقایسه با صدای کوتاه بر نواحی مغزی

8 - 122- Multi Blocked Design

9 - 123- طراحی مرتبط با یک رویداد

10 - 124- Block Vs. Event Related Designs

11 - 125- Periodic Signal Trial Design

12 - 126- طراحی مختلط

13 - 127- جمع بندی

جلسه ۱۳- تصویربرداری ساختاری (عملی)

1 - 128- مقدمه

2 - 129- FAST-1

3 - 130- - FAST-2

4 - 131- First

5 - 132- اجرای First

6 - 133- VBM-1

7 - 134- VBM-2

8 - 135- Voxel Based Analysis of GM Volume

9 - 136- تفاسیری از تفاوت‌ها

10 - 137- اجرای FSL-VBM

11 - 138- Free Surface

12 - 139- عملی-1

13 - 140- عملی-2

14 - 141- عملی-3

15 - 142- عملی_4

16 - 143- عملی-5

17 - 144- عملی-6

18 - 145- عملی-7

مدتی پیش در کارگاهی که با مدیریت دکتر حامد اختیاری و با تدریس اساتید مختلف برگزار گردید اصول تصویربرداری مغزی عملکردی و ساختاری و نحوه طراحی و اجرای مطالعه در این حوزه مورد بررسی قرار گرفت.
ویدئوهای این کارگاه با حمایت ستاد توسعه علوم و فناوری‌های شناخت در این مکان قابل دسترس عموم علاقمندان است.
این کارگاه می‌تواند در‌واقع تکمیلی بر درس‌های قبلی منتشر شده از دکتر اختیاری پیرامون علوم اعصاب شناختی و فناوری‌های نقشه‌برداری مغزی باشد. امکانات کنونی آزمایشگاه ملی نقشه‌برداری مغز، اجرای عملی آموزش‌های این کارگاه را در داخل کشور تسهیل نموده است.

حامد اختیاری	تارا رضاپور
مهدی تهرانی دوست	حمید یعقوبی

حامد اختیاری	سپیده بخت
سارا هاشمی	فائزه رئیس المحدثین
سارا درفشه	ونوس هادیان
شیما اورعی	نرگس سادات اخوت

حامد اختیاری	تارا رضاپور
الهام اختیاری	عاطفه رضائی
زینب رحمتی	ثمینه سادات پورتاک‌دوست
ساراسادات مهدوی

کارگاه تصویر‌برداری مغزی (ساختاری و عملکردی)

تمرکز، قطعه گمشده از پازل موفقیت دنیای امروز

روش‌های مطالعه و مداخله در علوم اعصاب شناختی (دوره تکمیلی)

وبینار مهرتن؛ مغز هوشمند راز تندرستی ویژه

مداخلات عصبی شناختی در چاقی و بیش‌خوری

تربیت مدرس باشگاه مغز